Pedagogické metódy v Citadele sú založené na vnútornej motivácii dieťaťa. Snažíme sa vytvárať láskyplné a rešpektujúce prostredie. Z tohto dôvodu nepoužívame známkovanie, ale spätnú väzbu a slovné hodnotenie.

Tiež si uvedomujeme, že na to, aby mali deti vhodné a bezpečné prostredie na učenie, potrebujú nielen veľa lásky, ale aj hranice. Preto máme vytvorené Citadelovské školské pravidlá a procesy. Pomáhajú deťom ľahšie sa orientovať v aktivitách, sústrediť sa na prácu a dobre spolu vychádzať.